伊洛瓦底江和怒江的垂直切割，塑造了高黎贡山典型的高山峡谷地貌，造就了其独特的垂直自然景观，使之成为全球少有的跨境的集热带、亚热带、温带和寒带于一体的完整的生态系统垂直系列，再加上复杂的地形地貌，使高黎贡山具备了极其多样的生态系统。而多样的生态系统也孕育着极其丰富的物种多样性。

　　野生植物资源十分丰富，特有及保护植物众多。高黎贡山已知记载有高等植物252科1353属5726种（亚种、变种），其中，有大树杜鹃、保山莤、杏黄兜兰、美丽龙胆、黑紫獐牙菜、膜叶双蝴蝶等382种高黎贡山特有植物；有须弥红豆杉、南方红豆杉、光叶珙桐、虎斑兜兰、云贵水韭、贡山三尖杉等135种国家一、二级保护野生植物；著名的“云南八大名花”—兰花、杜鹃、木兰、山茶、龙胆、报春、百合、绿绒蒿在高黎贡山均有分布；此外，高黎贡山有兰科植物363种，是中国兰科植物最丰富的地区之一；有杜鹃花科植物235种。

　　高黎贡山已知记载有高等植物252科1353属5726种（亚种、变种），云南八大名花在高黎贡山均有分布。

　　野生动物资源丰富，是中国灵长类动物最多的地区之一。初步统计，高黎贡山地区有各种动物3456种，其中，兽类206种，鸟类750种，两栖类54种，爬行类76种，鱼类70种，昆虫2000多种，蜘蛛300多种。已知有高黎贡羚牛、孟加拉虎、云豹、林麝、穿山甲、白尾梢虹雉、黑鹳、金雕、绿孔雀等232种国家一、二级保护野生动物；有高黎贡白眉长臂猿、怒江金丝猴、戴帽叶猴、菲氏叶猴、熊猴、藏酋猴、蜂猴、短尾猴、猕猴、白颊猕猴10种灵长类动物，占云南省灵长类的62.5%、中国灵长类的38.46%。

　　据不完全统计，高黎贡山地区有各种动物3456种，其中，兽类206种，鸟类750种，两栖类54种，爬行类76种，鱼类70种，昆虫2000多种，蜘蛛300多种。

　　鸟类资源丰富，是中外有名的观鸟胜地。高黎贡山已知分布有鸟类20目92科750种，占云南鸟类总数1013种的74.04%，占中国鸟类总数1445种的51. 9%。其中，有红胸角雉、灰腹角雉、白尾梢虹雉、黑颈长尾雉、红腹角雉、血雉、白鹇、白腹锦鸡、红原鸡等国家重点保护的一、二级鸟类155种。高黎贡山的鸟类种类多，数量大，分布集中，鸟类体色五彩斑斓，引人入胜，鸣声千差万别，婉转动听。这里鸟类活动集中，是中国最适于开展观鸟生态旅游的地区之一；其中，百花岭是中国新的观鸟热点地区。

　　高黎贡山分布有鸟类20目92科750种，占云南鸟类总数1013种的74.04%，占中国鸟类总数1445种的51.9%。

　　昆虫资源丰富，是中国蛾类资源最为丰富的地区。高黎贡山由于纵列的山体及气候条件，分布有古北区系的昆虫（如朽木蛾、彊夜蛾、白杨叶甲等）和东洋区系的昆虫（如漆树双沟跳甲、黄色漆树跳甲、柱胸叶甲等），两大区系的昆虫交叉重叠，特有种较多，如分布有腾冲污灯蛾、红足光背奇蝽、桑潜吉丁、苎麻双脊天牛等44多种高黎贡山特有昆虫。

　　初步统计，高黎贡山地区有昆虫2000多种，其中，已知分布有绿尾大蚕蛾、灰星迟蛾、端黄卷蛾、聂烟卷蛾、美点绿刺蛾、金双点螟、乳翅锦斑蛾等1005种蛾类。